数据依赖采集蛋白质组学（Data-Dependent Acquisition, DDA）是用于蛋白质组学研究的常见质谱（MS）技术，通过对样品中的肽段进行选择性分析，从而识别和定量蛋白质。数据依赖采集蛋白质组学（DDA蛋白质组学）的基本原理是通过质谱仪对目标样品进行扫描，选择性地对数据依赖的模式进行采集。该方法可以在单次实验中识别和鉴定大量蛋白质，从而为深入了解生物系统的动态变化提供关键数据。DDA蛋白质组学在蛋白质鉴定、蛋白质量的定量分析、蛋白质修饰的识别等方面起到了至关重要的作用。在药物开发过程中，科学家可以借助DDA蛋白质组学技术分析药物与靶蛋白的相互作用，揭示药物作用机制，进而优化药物设计。在疾病诊断中，通过对患者样品进行DDA蛋白质组学分析，可以识别疾病相关的蛋白表达谱，为早期诊断和个性化治疗提供信息。此外，DDA蛋白质组学还被用于追踪生物体内的蛋白质动态变化，例如监测细胞在不同环境下蛋白质的表达变化，研究细胞信号传导路径等。

一、数据依赖采集蛋白质组学（DDA蛋白质组学）原理

DDA蛋白质组学主要依赖于质谱仪在数据采集过程中的两步操作：

1、一级质谱（MS1）

（1）质谱仪对样品中的所有肽段进行扫描，生成全范围的母离子谱图。

（2）MS1阶段记录母离子的质荷比（m/z）和相对丰度。

2、二级质谱（MS2）

（1）基于MS1中选定的高丰度母离子，质谱仪触发碎裂（如通过碰撞诱导解离，CID），生成子离子。

（2）MS2阶段捕获子离子的信息以用于肽段和蛋白质鉴定。

（3）DDA方法优先分析丰度较高的离子，而低丰度的离子可能被忽略。这种选择性特性对定性分析较有利，但可能存在一定的定量偏差。

二、核心方法与技术流程

1、样品制备：从生物样本中提取蛋白质、进行蛋白质变性和酶切，以便生成适合质谱分析的小肽段。

2、分离技术：使用液相色谱技术对酶解后的肽段进行分离。高效液相色谱（HPLC）可以有效地减少样品复杂性，提高质谱分析的灵敏度和分辨率。

3、质谱分析：质谱仪利用电喷雾或基质辅助激光解吸电离技术对分离后的肽段进行电离，然后通过质量分析器选择性地检测和鉴定肽段。在DDA模式下，质谱仪自动选择最强信号的肽段进行碎片化，获得其质谱图。

4、数据分析：通过生物信息学软件对获得的质谱数据进行分析。通常使用数据库搜索方法与已知蛋白质数据库进行比对，以实现蛋白质的鉴定和定量。

三、数据依赖采集蛋白质组学（DDA蛋白质组学）优势

1、高通量识别：能够在单次实验中识别数千种蛋白质，适合大规模蛋白质组研究。

2、灵活性强：适用于多种类型的生物样品，包括细胞、组织和体液样品。

3、高灵敏度和高分辨率：能够检测低丰度蛋白质和进行蛋白质修饰的深入分析。

4、可靠性强： 通过数据库比对，提供准确的蛋白质鉴定结果。

采用ISO9001质量控制体系，获国家CNAS实验室认可，百泰派克生物科技为科研人员提供先进的数据依赖采集蛋白质组学（DDA蛋白质组学）分析服务。我们拥有经验丰富的团队和高效的分析平台，致力于为客户提供高质量的数据分析支持。我们的服务涵盖蛋白质鉴定、定量分析和复杂生物样品的全面解析，帮助客户在科研领域取得突破性进展。欢迎与我们合作。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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